馬鞍山二本院校有馬鞍山學院和皖江工學院。這兩所學校在安徽是第二批次招生。自2020年開始，安徽高考本科二批、三批合并為本科二批招生。

馬鞍山學院

馬鞍山學院，前身是安徽工業(yè)大學工商學院，成立于2003年6月，是由安徽工業(yè)大學申辦，經(jīng)教育部和安徽省人民政府批準設立的獨立學院。2020年12月，由安徽工業(yè)大學與深圳市賽為智能股份有限公司合作舉辦安徽工業(yè)大學工商學院，2020年6月，經(jīng)教育部批準，安徽工業(yè)大學工商學院轉設為馬鞍山學院。學院位于安徽省馬鞍山市當涂縣黃池路8號，占地面積1000畝，交通便捷，氣候宜人。

皖江工學院

皖江工學院，坐落于全國文明城市——安徽省馬鞍山市，是經(jīng)教育部批準，擁有學士學位授予權的省屬普通本科高校。學校前身為河海大學與江蘇大業(yè)投資有限公司、無錫市大業(yè)房屋建設開發(fā)有限公司合作舉辦的獨立學院——河海大學文天學院，2008年5月7日經(jīng)教育部批準設立，2020年順利通過學士學位授予權評審，被批準為學士學位授予單位。2020年學校經(jīng)國家教育部評審，成功轉設為獨立設置的民辦本科學校，更名為皖江工學院。學校占地面積1700畝，分霍里山和鄭蒲港兩個校區(qū)。校舍建筑面積40.57萬平方米。